alguien sabe donde puedo modificar que cuando hagan master reset les deje el arbol en 0 puntos tanto como nivel y como puntos?

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Hola vas a tener que agregar una linea que resetee el árbol en la sección del MasterReset, eso en la bases de datos.
Mas o menos en esta parte:

1- Abris SQL y vas a la base de datos MuOnline
2- Abris las pestañas en el + y vas a Programmability > Stored Procedures
3- Entras a dbo.SetMasterResetInfo
4- Buscas esta línea

UPDATE Character SET ResetCount=@Reset WHERE AccountID=@account AND Name=@Name

Y ahí debajo debes agregar una linea haciendo un Update.
No estoy muy seguro pero sería algo así:

UPDATE dbo.MasterSkillTree SET MasterLevel, MasterPoint, MasterExperience = 0